Pondok Pesantren Mahasiswa (PPM) Ar-Royyaan Baitul Hamdi Yogyakarta bermula dari sebuah inisiatif mulia bernama "Griya Mahasiswa" yang didirikan sekitar tahun 1992. Tujuan awal pendirian griya ini adalah untuk menyediakan sarana tempat tinggal sekaligus wadah pembinaan keagamaan yang intensif bagi para mahasiswa warga LDII yang sedang menempuh pendidikan tinggi di berbagai universitas ternama di Yogyakarta.
Seiring berjalannya waktu, seiring pesatnya pertambahan jumlah mahasiswa dan kebutuhan pembinaan yang lebih komprehensif, terstruktur, dan formal, Griya Mahasiswa ini secara resmi bertransformasi dan dilembagakan menjadi Pondok Pesantren Mahasiswa (PPM) pada tahun 2010 di bawah naungan DPD LDII Kota Yogyakarta.
Kini, PPM Ar-Royyaan Baitul Hamdi telah berkembang menjadi salah satu pondok pesantren mahasiswa teladan yang sukses memadukan prestasi akademik perkuliahan dengan kemantapan pemahaman ilmu agama Islam yang murni berlandaskan Al-Qur'an dan Al-Hadist.
PPM Ar-Royyaan Baitul Hamdi senantiasa menanamkan karakter luhur bagi seluruh santri mahasiswanya demi membentuk kepribadian mulia dalam bermasyarakat melalui 6 Tobiat Luhur:
Memiliki pemahaman mendalam tentang ilmu agama Islam berdasarkan Al-Qur'an dan Al-Hadist, serta mampu mengamalkannya dalam kehidupan sehari-hari.
Memiliki budi pekerti yang luhur, sopan santun yang tinggi, serta karakter yang mulia sebagai cerminan pribadi Muslim yang taat.
Memiliki bekal keterampilan hidup (*soft skill*), kemandirian finansial dan sosial, serta kesiapan mental untuk terjun di masyarakat.